Në kohët e lashta në shërbim të perandorëve të Japonisë ishte urdhri i ninja. Këto luftëra misterioze posedonin aftësitë më të mira të inteligjencës në atë kohë dhe ata ishin të gjithë artistë ushtarakë. Sot, në Run Ninja lojë, ne do t'ju ndihmojmë një luftë të tillë për të depërtuar në territorin e armikut. Heroi ynë do të kandidojë përgjatë rrugës, e cila është e mbushur me kurthe të ndryshme dhe rreziqe të tjera. Ju mund të shumica e tyre hidhen mbi në shpejtësi dhe të kandidojë për. Nëse takoni ushtarët e armikut, përpiquni t'i shkatërroni. Gjithashtu në rrugë mbledhin sende të ndryshme shtrirë në tokë. Ata do t'ju japin pikë dhe bonuse të tjera të mira.