Në të ardhmen e largët, shkencëtarët kanë mësuar të zvogëlojnë objektet në madhësi mikroskopike. Sot në lojën Spore Hunter, ata vendosën të dërgojnë pilotin në një aeroplan të posaçëm për të eksploruar botën mikro. Heroi juaj do të duhet të fluturojë përgjatë një rrugë të caktuar dhe të eksplorojë këtë botë. Krijesat që përbëhen nga sporet do të sulmojnë heroin tonë. Numrat e gdhendur do të jenë të dukshëm në to. Ata do të thotë se sa goditje ju duhet t'i bëni krijesës për ta shkatërruar atë. Ju me mençuri të manovruar në anijen tuaj do të qëlloni në të nga arma juaj dhe shkatërroni sporet.