Frutat në Fruit Ninja nuk janë menduar të hahen si sallata ose thjesht për argëtim. Një tufë frutash u mblodhën nga heroi i lojës ninja, për të mos humbur aftësitë e tij me një shpatë katana. Heroi punon si kuzhinier në një kafene, disa vjet më parë ai u largua nga vendi i tij i lindjes jo me vullnetin e tij të lirë, por duke u fshehur nga mafia vendase. Por duart e mafies janë të gjata dhe mund ta gjejnë atë në çdo kohë, që do të thotë se duhet të jesh i përgatitur dhe të kërkohet trajnim. Dhe meqenëse nuk ka pajisje speciale sportive në dispozicion, do t'ju duhet të përdorni fruta. Asistenti do të hedhë shalqinj, banane, mollë, kivi dhe fruta të tjera dhe ju do t'i prisni në Fruit Ninja.
