Një horr i njohur në qytet ka rrëmbyer shoqen e Turtles Teenage Mutant Ninja, një vajzë të quajtur April. Tani heronjtë tanë do të duhet ta shpëtojnë atë. Ju jeni në një lojë të re emocionuese në internet Teenage Mutant Ninja Turtles Shadow Heroes do t'i ndihmojnë ata në këtë aventurë. Para së gjithash, do t'ju duhet të zgjidhni një personazh dhe një armë që ai do të përdorë në luftime. Pas kësaj, heroi juaj do të shfaqet në një vend të caktuar. Duke përdorur çelësat e kontrollit, ju do të drejtoni veprimet e tij. Karakteri juaj do të duhet të ecë përpara për të kapërcyer rreziqe dhe kurthe të ndryshme. Pasi të ketë takuar kundërshtarë, ai do të përdorë armët e tij dhe do të shkatërrojë armiqtë. Për çdo armik që mposhtni, do t'ju jepen pikë në "Teenage Mutant Ninja Turtles Shadow Heroes".