Një personazh pelte i quajtur Misty nis një udhëtim nëpër një botë unike të platformës në MystiCloned. Rruga e tij do të jetë interesante, por mjaft e vështirë nëse nuk e ndihmoni të kapërcejë pengesat. Për këtë, heroi do të ketë nevojë për portale të veçanta. Duke kaluar nëpër to, heroi do të marrë një numër të caktuar klonesh në dispozicion të tij. Ata duken si hero, por janë të lyer me të zezë. Nëse dëshironi që kloni të ndalojë në një vend të caktuar, klikoni mbi të me butonin e mausit dhe kloni do të kthehet në rozë të zbehtë dhe do të qëndrojë në vend. Kjo do të nevojitet kur duhet të rregulloni një buton për të hapur derën. Në të ardhmen, ju gjithashtu duhet të përdorni klone në mënyra të ndryshme për të kapërcyer pengesa të ndryshme në MystiCloned.