Shkencëtarët në të gjithë botën, secili në fushën e vet, po punojnë pa u lodhur për të bërë një zbulim të madh. Megjithatë, vetëm disa kanë sukses, shumica e studimeve mbeten të papërfunduara. Financimi i tyre është mbyllur për shkak të mungesës së premtimeve ose dështimeve në eksperimente. Heroinat e lojës Misteret e Bibliotekës janë studente të një prej universiteteve të famshme. Amelia, Candice dhe Ava janë të apasionuar pas shkencës dhe duan të bëhen të famshëm. Ata mësuan se një nga profesorët në institucionin e tyre ishte i angazhuar në një zhvillim serioz shkencor, por projekti u mbyll dhe profesori u zhduk. Vajzat do të donin t'i gjenin veprat e tij në bibliotekën e universitetit dhe t'i studionin ato. Ndihmoni vajzat në Misteret e Bibliotekës.
