Në një vend përrallor jetojnë ponet magjike, të cilat mbajnë një ekuilibër mes forcave të dritës dhe errësirës. Shumë shpesh ata duhet të ndërhyjnë dhe të shkatërrojnë monstra të ndryshme që shfaqen në pjesë të ndryshme të vendit magjik. Sot në lojë Pony im i vogël: Guardians of Harmony, ne do të bashkohet me një prej tyre. Karakteri juaj do të duhet të kalojë nëpër luginë dhe të shkatërrojë të gjitha monsters që takuat. Në mënyrë të mbledhë gems, ata do t'ju japë pronat magjike. Zemra do të rivendosë jetën tuaj. Për të sulmuar armikun, ju duhet ta shpërndani atë me bririn tuaj, që është në përkrenare.