Në një botë të largët mahnitëse, krijesa të tilla si Pokemon jetojnë. Ata janë të ndarë në grupe që adhurojnë shpirtrat e natyrës. Dikur, adhuruesit e shpirtrave të Zjarrit dhe Ujit kryen një ritual dhe thirrën këto ente hyjnore në këtë botë. Por ata dolën të ishin shpirtra shumë të këqij dhe dolën jashtë kontrollit. Tani i gjithë planeti është në kaos dhe fatkeqësitë natyrore po ndodhin vazhdimisht. Ju në lojë Pokemon Emerald Version do të duhet t'i luftoni. Para jush në ekran do të shihni një zonë të caktuar në të cilën do të vendosen personazhet tuaj. Ata do të sulmojnë për shembull frymën e Zjarrit. Ju do t'i drejtoni veprimet e tyre duke përdorur një panel kontrolli të dedikuar. Me ndihmën e tij, ju do të detyroni Pokemonët tuaj të aplikojnë magji të ndryshme magjike me të cilat ata do të dëmtojnë kundërshtarin e tyre.
