Qëllimi i piratëve është piastra e artë, dhe sa më shumë, aq më mirë. Një fregatë e madhe me një ekip piratësh në bord nën flamurin e Jolly Roger lëviz në një ishull të vogël ku fshihen arkë me monedha ari. Kapiteni dëshiron t'i marrë dhe të dalë në pension, duke i ndarë midis anëtarëve të ekuipazhit. Por kur iu afrua ishullit, një grup i çuditshëm i flluskave me shumë ngjyra Bubble Shooter Pirates 3 u shfaq papritur dhe piastrat shkëlqejnë mes tyre. Piratëve nuk u pëlqeu aspak kjo dhe ata vendosën të qëllonin flluska në mënyrë që të merrnin arin. Rregulloni topin tuaj dhe qëlloni. Nëse bashkohen tre ose më shumë flluska me të njëjtën ngjyrë, ato do të shpërthejnë në Pirates 3 Bubble Shooter 3.