Në Ben 10: Brains vs Bugs do t'ju duhet të ndihmoni një alien qesharak të gjelbër për të liruar miqtë e tij të rrëmbyer. Para jush, karakteri juaj do të jetë i dukshëm në ekran, i cili do të jetë i vendosur në një vend të caktuar. Duke përdorur çelësat e kontrollit, ju do të drejtoni veprimet e tij. Heroi juaj do të duhet të ecë përgjatë një rruge të caktuar, duke kapërcyer kurthe të ndryshme dhe rreziqe të tjera. Gjatë rrugës, ai do të mbledhë monedha ari dhe sende të tjera të dobishme që do t'ju sjellin pikë në lojën Ben 10: Brains vs Bugs dhe mund t'i japin personazhit lloje të ndryshme shpërblimesh. Gjithashtu, karakteri juaj do të duhet të luftojë mete që do të hasin në rrugën e tij.
