Fabrika e prodhimit të animatronics është mbyllur për një kohë të gjatë, por një duzinë roje tashmë janë zhdukur atje dhe duhet bërë diçka për këtë. U vendos mbyllja e fabrikës, duke e vulosur fort. Por së pari ju duhet të bëni një pastrim, duke shkatërruar mbetjet e animatronics, nëse ka. Në lojën FNAF Shooter, ju armatoseni me dy pistoleta në të njëjtën kohë dhe shkoni të shikoni punëtoritë. Një surprizë ju pret: rezulton se ka edhe më shumë lodra të liga se sa kishte përpara mbylljes së fabrikës. Gjatë gjithë kësaj kohe ata kanë krijuar fshehurazi vetë-riprodhim dhe në çdo nivel animatronics do të kërcejnë para jush një nga një. Thjesht keni kohë për t'i qëlluar në FNAF Shooter.
