Mbretëria e kërpudhave ka pësuar një pushtim alienësh. Robotët e huaj ecin përgjatë platformave dhe rrugëve, duke kërcënuar të gjithë banorët me kthetrat e tyre të hekurta. Mario është i vetmi që është në gjendje t'i rezistojë agresorit, ai tashmë ka ngrënë kërpudha, është bërë një Super Mario i madh, i armatosur me një çekiç dhe gurë dhe është gati për të luftuar. Ndihmoni heroin, ai do të lëvizë mjaft shpejt, dhe ju, duke shtypur butonat e zgjedhur në këndin e poshtëm të djathtë, bëni që ai ose të hedhë gurë ose të godasë armikun me një çekiç. Bettershtë më mirë të hedhësh gurë në robotë më të mëdhenj. Dhe për ato të vogla, një goditje e fortë në kokë në Super Mario Run është e mjaftueshme.